Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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