Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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