Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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