Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms