Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms