Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC17A6Q9P2U8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms