Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN3Q9P232 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms