Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms