Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR88Q9GZN0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms