Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AMBRA1Q9C0C7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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