Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms