Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB6Q9BUF5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB6Q9BUF5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms