Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms