Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms