Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms