Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms