Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms