Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms