Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDCCAG3Q96C92 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms