Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF34Q969K3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms