Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms