Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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