Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms