Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WHAMMP3Q1A5X7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms