Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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