Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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