Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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