Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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