Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSPNQ14714 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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