Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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