Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms