Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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