Protein–RNA interactions for Protein: Q12967

RALGDS, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGDSQ12967 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALGDSQ12967 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms