Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms