Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms