Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms