Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms