Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms