Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKOR1P84550 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms