Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK8P49336 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms