Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC11A1P49279 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC11A1P49279 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms