Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTHFRP42898 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms