Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms