Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBRP36941 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms