Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms