Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms