Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHCGRP22888 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms