Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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