Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms