Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LTAP01374 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LTAP01374 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LTAP01374 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LTAP01374 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LTAP01374 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LTAP01374 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LTAP01374 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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